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环状 RNA 测序案例分析

点击次数：  更新时间：2016/3/1 11:47:56  

 

案例：以结肠癌，卵巢癌，特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性
 
背景：最新研究表明，circular RNAs大量存在，是构成生物体 RNA 网络的一部分，而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。
 
目的：利用 Illumina 测序平台对细胞增殖速度不同的样品（正常组织和细胞，不同肿瘤组织和细胞，非肿瘤疾病组织和细胞）的 circular RNAs 进行分析，探究 circular RNAs 的富集与细胞增殖的相关性。
 
结果：首次发现 circular RNAs 在组织和细胞的富集程度与细胞增殖速度呈现负相关关系，即肿瘤组织和细胞中 circular RNAs 表达量显著低于正常组织和细胞。
 
原文索引：
 Bachmayr-Heyda, A. et al. (2015). Correlation of circular RNA abundance with proliferation--exemplified with colorectal and ovarian cancer, idiopathic lung fibrosis, and normal human tissues. Sci Rep 5, 8057.

 

图 1：正常结肠组织与结肠癌组织的  circular RNAs  表达分析

 

 

 

图 2：不同组织中 circular RNAs  与  linear RNAs  的比例

 

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