金洁教授:二代测序技术在AML诊疗中的重要性日益上升
急性早幼粒细胞白血病(APL)是一类较为特殊的急性髓细胞白血病(AML)亚型,其诊断主要通过定量PCR和FISH检测。APL的诊治应遵循早期诊断及早期治疗的原则,因此APL的早期诊断尤为重要。
绝大部分情况通过PCR手段发现PML-RARα基因时,就可确诊为APL。但极个别APL患者会出现特殊类型的融合基因,如日本发现的NUP98-RARγ融合基因、以及苏州大学附属第一医院和北京大学人民医院发现的CPSF6-RARγ融合基因等,这些融合基因则需要通过二代测序技术才可确诊。临床上,当患者的细胞形态学类似于APL、且胞浆含有颗粒及Auer小体等情况时,需高度怀疑为APL。此时若PCR和FISH技术均无法准确诊断,则应当采用二代测序的方法进行诊断,进而指导下一步治疗。
微小残留病灶(MRD)的检测价值及手段
微小残留病(MRD)检测具有极其重要的意义。例如,对APL或CML患者而言,MRD检测可指导下一步治疗。当MRD检测为阴性时,则可尝试对APL或CML患者停药。此外,对AML1-ETO融合基因阳性的AML患者而言,若MRD检测为阴性,则提示AML患者可长期生存;反之,若MRD检测出AML-ETO融合基因水平持续较高时,则应通过造血干细胞移植来解决。
在MRD检测手段方面,目前定量PCR和流式细胞术是较为常用的检测手段。其中,流式细胞术在急淋(ALL)的MRD检测中已很成熟,对AML中的MRD检测也具有重要价值。此外,数字PCR是更深层次的MRD检测手段,适用于慢粒停药的情况。延伸到AML领域,数字PCR可用于检测AML1-ETO、IDH1/2、DNMT3A及NMP1等基因,对AML而言亦是极佳的MRD检测手段。值得注意的是,近年来,二代测序在MRD的检测中越发重要,其检测敏感性及特异性高,已显示出应用于临床常规MRD分子监测的潜力。
二代测序在恶性血液病中的诊疗价值
研究显示,通过二代测序可发现绝大部分的基因突变。在AML和MDS中,突变检出率均超过99%,这有利于发现新的治疗靶点、指导治疗及改善患者疗效。例如MDS伴5q-患者来那度胺的疗效很好,但是如果同时伴有TP53突变时,来那度胺的疗效则不理想,而换用地西他滨等其他治疗,改善疗效。
另外,二代测序在预后方面亦具有极其重要的补充和修正价值。例如,对于MDS患者而言,正常核型是预后良好的因素。但若通过二代测序发现了TP53或TET2等突变,则提示预后不佳,进而改变对疾病的认识,在治疗方案的选择方面也更为精准。最后,二代测序通过发现更多基因突变靶点,从而助力更多新药的研发,最终可提高恶性血液病的治疗。