一、DNA目的片段的扩增
反应体系:
cDNA(gDNA) | 2.0μL |
10×Buffer | 2.0μL |
Mg2+ | 1.6μL |
dNTPs | 1.2μL |
引物F | 0.6μL |
引物R | 0.6 μL |
Taq polymerase | 0.3μL |
ddH2O | 11.7μL |
Total | 20μL |
加适量石蜡油,扩增反应在PTC-220 Tetrad Thermal Cycler (MJ Research)上进行。
PCR反应程序:
*:PCR退火温度由引物序列(GC含量)决定。
二、琼脂糖凝胶电泳检测
(1)1g的琼脂糖倒入装有100mL NEB的三角瓶中。(一般0.2g琼脂糖加20ml水可以倒1/4面平板)
(2)微波炉加热至澄清无气泡,稍微冷却加1-2滴EB染色液;
(3)将胶倒入装置好的电泳托盘中,冷凝后放入电泳槽。
(4)点样,90V-120V,20min左右。
(5)电泳结束后置于凝胶成像仪下观察拍照。
三、片段的回收
(1)在紫外灯下切下含目的DNA的琼脂糖胶块,放入1.5mL的管中。
(2)按每100mg琼脂糖加入300μL DE-A液(溶胶液)的比例加DE-A液,置75℃ 6~8min,每2min颠倒一次离心管,直至胶块完全溶化(当目的片段小于400bp时,加入1/3 DE-A体积异丙醇。当目的片段大于400bp时,可省略此步骤)。
(3)加入1/2 DE-A体积的DE-B溶液,混合后转入吸附柱,12000g离心30s,倒去下管中的液体。
(4)在吸附柱中加入500μL W1液(洗涤液),12000g离心30s,倒去下管的液体。
(5)再在吸附柱中加入700μL W2液,静置1min,12 000g离心30s,倒去下管中的液体。重复一次。
(6)12000g离心1min。
(7)将吸附柱取出放入一个干净的1.5mL的离心管中,在吸附膜中央加入20μL TE,静置1min后(或稍长),12000g离心1min。
(8)弃去吸附柱,将含回收产物DNA的1.5mL离心管贮存于-20℃。
四、回收产物的连接
反应体系:
*注意:1)于16℃下连接8h,如有必要可以过夜连接;2)此处看回收纯化产物的浓度来调节ddH2O的用量,总量5μL
五、热击转化
依照转化具体操作步骤,将连接产物转入大肠杆菌DH5α感受态细胞中,涂板,37℃培养12~16h。
转化的具体操作步骤如下:
(1)取冰上溶解的100μL DH5a感受态至超净工作台,加入10μL连接产物,轻柔混匀,冰浴30min。
(2)转入42℃热击90s,迅速放于冰上2min。
(3)超净工作台加入400μLLB培养液,放于37℃摇床150r/min温和培养50min。
(4)8000rmp离心2min,去除部分上清,剩余沉淀轻轻悬起,涂布于含有100μg/mL Amp 的LB平板上,37℃培养16h。
六、 阳性克隆的鉴定
随机挑取白色菌落于含有200ml LB液体培养基(含相应抗生素)的0.5mL离心管中,37℃、225r/min摇动培养3~4小时后,用特异引物进行PCR扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR产物,鉴别出有正确插入片段的阳性重组克隆,送样测序
注:此处注意加相关对照,一般采用相同的片段大小来鉴定挑取的单克隆是否为目的基因。
七、附录: 大肠杆菌感受态细胞的制备
(1)挑取大肠杆菌DH10B的单菌落或者取未经污染的原菌0.5μL,接种到3μL SOB液体培养基中,37℃ 225r/min培养14~16小时。
(2)取出2mL转接到200mL新的SOB培养基中,继续培养约3小时至对数生长期(OD550=0.8)。
(3)冰上冷却10分钟后,4℃,7000g离心5分钟,弃上清,用10%甘油洗沉淀两次,每次离心收集,把沉淀物分装保存于-70℃备用。